莉娜是一名生物学家，一年前，她的丈夫凯恩在参加一项秘密任务后神秘失踪，这一年间，莉娜一直生活在悲伤之中。某天，失忆的凯恩忽然出现在了莉娜的面前，之后晕倒被送入了医院。在那里，莉娜遇见了文崔斯博士。博士告诉莉娜，凯恩被派往了一块被“闪光”笼罩的未知区域，三年间，无数的队伍被派往区域内进行勘探，只有凯恩一人活着回来了。不仅如此，“闪光”正在不断的扩大。为了查明事情的真相，莉娜自愿加入了下一批被派遣的队伍之中，和她一同前往的，除了文崔斯博士外，还有安雅和乔茜。

某生物学家(波特曼)为调查丈夫(伊萨克饰)的失踪，参加了神秘组织Southern Reach组织的科学考察，4名女性组队，去研究美国领土内一块被检疫隔离的生态灾害区域“X地区”。她发现那里是原生态的荒野，隐藏着神秘的黑暗力量。这已经是对该地区的第12次考察，前11次全都失败，比如第二次考察终结于去的考察队员集体自杀，第三次考察队拔枪互相残杀，第11次队员全体失去神志，回来后不久都死于癌症……

深渊代表着纯粹的湮灭，遵循着本能吞噬世间的一切生命。 然而某一天里，它们中出了叛徒——懵懂少女希尔维嘉在战场上醒来，得知自己竟然是被人类憎恶的“白夜深渊”，经历种种后，希尔维嘉逐渐坚定自己的信念，想要凭借深渊之躯，拯救人类的命运，守护心中的善良和温暖。